Des centaines de milliers de personnes ont fêté sa victoire jusque tard dans la nuit, dimanche 25 juin, sur la place Tahrir, au Caire, symbole de la révolution qui a renversé Hosni Moubarak en février 2011. Mohammed Morsi a été élu président de l'Egypte, obtenant 51,73% des voix contre 48,27% pour Ahmad Chafiq, dernier Premier ministre du président déchu.
Le candidat des Frères musulmans est le premier islamiste à accéder à la magistrature suprême en Egypte. Il a promis d'être le président de "tous les Egyptiens", en appelant à l'unité nationale et en assurant qu'il respecterait les traités internationaux signés par son pays.